DNA提取各种缓冲液的配
制
Prepared on 24 November 2020
植物总DNA的提取
一、所需仪器设备及消耗品
剪刀、塑料袋(封口)、冰箱、棕色广口瓶(1000、500、200、100、50ml)、量筒(1000、500、100、10ml)、烧杯(1000、500、200、
100ml)、pH试纸、电子天平、高压灭菌锅、研钵、液氮罐(液氮)、水浴锅、离心机、移液器(1套)、枪头(1ml、200ml、20μl)、枪头盒、离心管()(包括盒和架)、一次性手套、电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片
二、所需化学药品及试剂
CTAB、NaCl、EDTA-Na2·2H2O、Tris、冰乙酸、硼酸、β-巯基乙醇、NaAc、氯仿(三氯甲烷)、异戊醇、无水乙醇、溴酚蓝、琼脂糖、蔗糖、溴化乙锭(EB)、RNase、NaOH、HCl(浓)、ddH2O
三、各种缓冲液的配制
(一)2%CTAB提取缓冲液(300ml)(高压灭菌)
4mol/L的NaCl 35ml×3=105ml 1mol/L的Tris-HCl 10ml×3=30ml L的EDTA 4ml×3=12ml CTAB 2g×3=6g
(二)1×TE(母液)(50ml)(高压灭菌)
1mol/L的Tris-HCl() 500μl L的EDTA() 100μl 最后加ddH2O定容到 50ml
工作液为×TE(45ml灭菌的ddH2O中,加入5ml已灭菌的1×TE)
(三)4mol/L的NaCl(150ml)(高压灭菌)
35.055g的NaCl,加ddH2O120ml溶解,再加水定容到150ml (四)1mol/L的NaCl(400μl)(用于配制RNase储存液) 取4mol/L的NaCl(已灭菌)100μl,加300μl灭菌的ddH2O。
(五)3mol/L的NaAc溶液()(50ml)(高压灭菌)
NaAc·3H2O 20.405g 加ddH2O 30ml 用冰乙酸调节pH至 加ddH2O定容到 50ml
(六)RNase储存液(10mg/ml)(1ml)
1mol/L的Tris-HCl() 10μl 1mol/L的NaCl 15μl RNase 10mg 沸水浴15~20min
(七)EB储存液(1mg/ml)
EB 30mg ddH2O 30ml
磁力搅拌至完全溶解,装入棕色瓶,铝箔包裹,保存于室温。 制胶时EB终浓度为μg/ml(30ml加15μl、40ml加20μl)
(八)10×TBE缓冲液(电泳缓冲液)(高压灭菌)
Tris碱 54g 硼酸 L的EDTA() 20ml
以上溶于400ml的ddH2O中,在定容到500ml 工作液为1×TBE或×TBE (九)6×上样缓冲液(4℃保存)
%的溴酚蓝(1ml 40%(w/v)的蔗糖水溶液)
40%(w/v)蔗糖水溶液(2g/5ml的ddH2O,加热溶解,注:温度不能太
高)
(十)1mol/L的HCl溶液(不用灭菌)
ml的浓盐酸,加灭菌ddH2O ,混匀,室温保存(100ml)。
(十一)5mol/L的NaOH溶液(50ml,10g的NaOH溶于50ml灭菌的ddH2O中)(不用灭菌)
200g的NaOH,溶于灭菌的ddH2O中,定容至1000ml
(十二)1mol/L的Tris-HCl()(100ml)(高压灭菌) 12.11g的Tris碱 80ml的ddH2O
加浓盐酸调节pH值至(大约加) (十三)L的EDTA()(50ml)(高压灭菌) 9.305g的EDTA-Na2·2H2O
1g的NaOH 磁力搅拌器剧烈搅拌 40ml的ddH2O
最后加水定容到50ml,用NaOH调节pH值至
DNA定量用紫外分光光度计法,1 OD260≈50μg/ml双链DNA。
PCR(聚合酶链反应)
一、所需仪器设备及消耗品
冰箱(4℃、20℃)、高压灭菌锅、离心机、移液器(1套)、枪头、枪头盒、PCR管(包括盒和架)、PCR仪、离心管(包括盒和架)、一次性手套、
电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片
二、所需化学药品及试剂
质粒(阳性对照)、引物(1、2)、4×dNTP、DNA模板、buffer(MgCl2)、TaqDNA聚合酶、ddH2O、琼脂糖、DNA标准样品(DNA ladder)、溴化乙锭(EB)、5×TBE电泳缓冲液(Tris、硼酸、EDTA)
三、PCR反应体系与反应程序
仅供参考
成分 无离子水 缓冲液(buffer) MgCl2 4×dNTP 引物 TaqDNA聚合酶 模板DNA 操作顺序:
① 水、4×dNTP混合
② buffer、taqDNA聚合酶混合,①、②混合 ③ 加入引物
④ 混匀、分装PCR管
⑤ 向每个PCR管加入模板DNA PCR扩增反应程序:
94℃预变性3~5min。
10× 25mmol/L 2mmol/L 5pmol/L
5U/μl 母液浓度
各成分加入量(μl/20μl)
2 2 2
各成分终浓度
或含量
1× mmol/L mmol/L L 3U 50ng
20ng/μl
进入循环:94℃变性30s→56℃退火30~45s→72℃延伸1~2min,30~36个循环。
循环结束后再72℃延伸7min。
外源脱水应答转录因子DREB基因在转基因小麦中的诱导型表达与抗旱生理效果
Induced Expression of DREB Transcriptional Factor and Study on Its Physiological Effects of Drought Tolerance in Transgenic Wheat
成分 无离子水 缓冲液(buffer) 4×dNTP 引物1 引物2 TaqDNA聚合酶 模板DNA PCR扩增反应程序:
94℃预变性5min。
进入循环:94℃变性45s→45℃退火45s→72℃延伸1min,35个循环。 循环结束后再72℃延伸10min。
一般PCR反应中引物的终浓度为~μmol/L,≥μmol/L时,特异性降低或形成引物二聚体,≤μmol/L时,降低产量。
PCR反应中每种dNTP的终浓度为20~200μmol/L。
所用引物浓度是5μmol/L吗
PCR反应时,每个引物的终浓度是多少4×dNTP的终浓度是多少TaqDNA聚合酶的终浓度是多少模板DNA的终浓度是多少
5U/μl 母液浓度
各成分加入量(μl/25μl)
13
各成分终浓度
或含量
1× mmol/L 1μmol/L 1μmol/L 1U 50ng
10× 2mmol/L
2 5 5 1
20ng/μl
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