不合法。员工顶撞上司不可以罚款。个人的单位没有罚款的权利，只有行政机关有。且对上司的顶撞属于个人道德问题，不是违法的问题，所以不存在罚款的情形。即便是顶撞上司违反单位的规章制度，且规章制度明确这样要罚款，也不能罚款，单位的规章制度不能违反法律强制性规定。
法律依据:
《中华人民共和国劳动法》 第五十六条 劳动者在劳动过程中必须严格遵守安全操作规程。
劳动者对用人单位管理人员违章指挥、强令冒险作业，有权拒绝执行；对危害生命安全和身体健康的行为，有权提出批评、检举和控告。
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