房屋转让协议涂改内容如果是真实的意思表示，双方都没有异议的，涂改的合同，也是有法律效力的，如果另一方不认可就是无效的。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第五百四十三条 当事人协商一致，可以变更合同。法律、行政法规规定变更合同应当办理批准、登记等手续的，依照其规定。
第五百四十四条 当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
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