法律分析：保险公司拒赔脑干疾病存在可能的违规行为。保险公司作为商业机构，应当以合法、公平、诚信为原则，按照合同约定向被保险人提供服务，但如果保险公司拒绝理赔符合保险合同的脑干疾病，可能涉嫌违反保险法等相关法律法规。
法律依据：
1.《保险法》第十一条：保险公司应当以公平、诚信的原则，按照合同约定向被保险人提供保险服务。
2.《保险法》第十九条：保险公司应当根据合同约定承担保险责任，及时履行理赔义务。
3.《保险法》第五十二条：保险公司违反保险法及其实施条例的规定，损害被保险人合法权益的，由保险机构承担相应的法律责任。
保险公司拒赔脑干疾病是否违规，需要具体情况具体分析。被保险人如果认为自身权益受到侵害，可以向保险公司提出理赔申请，并在合理期限内保留相关证据材料，如有需要可以寻求法律援助或者启动法律程序进行维护。
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