发票申请超限量不通过的原因是税务局在控制发票的数量，把控乱开票情况。在电子税务局中申请最高开票限额没有通过，说明税务局认为申请最高开票限额的条件和理由不充分。
《中华人民共和国发票管理办法》
第十五条
需要领购发票的单位和个人，应当持税务登记证件、经办人身份证明、按照国务院税务主管部门规定式样制作的发票专用章的印模，向主管税务机关办理发票领购手续。主管税务机关根据领购单位和个人的经营范围和规模，确认领购发票的种类、数量以及领购方式，在5个工作日内发给发票领购簿。单位和个人领购发票时，应当按照税务机关的规定报告发票使用情况，税务机关应当按照规定进行查验。
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