法律分析：被单位扣工资的处理方法如下：
1、可以向劳动监察部门投诉；
2、申请劳动仲裁仲裁；
3、如以用人单位克扣工资为由解除劳动合同的，用人单位还需向劳动者支付解除劳动合同的经济补偿金，标准为按劳动者在本单位工作的年限。
一、公司拖欠工资的处罚标准：
1、以转移财产、逃匿等方法逃避支付劳动者的劳动报酬或者有能力支付而不支付劳动者的劳动报酬，数额较大，经政府有关部门责令支付仍不支付的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；
2、对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚；
3、尚未造成严重后果，在提起公诉前支付劳动者的劳动报酬，并依法承担相应赔偿责任的，可以减轻或者免除处罚。
二、单位扣工资的处罚如下：
1、支付劳动者应得的工资，经济补偿金；
2、支付1到5倍的赔偿金；
3、支付应得工资报酬的25%的额外经济补偿金。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》
第四十七条 【经济补偿的计算】经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
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