确认劳动合同无效的机关有人民法院或者劳动仲裁委员会。一般劳动者入职后用人单位都会跟劳动者签订劳动合同，正规的单位都会遵守相关的规定签订具有法律效力的合同，如果对劳动合同是否有效存在质疑可以到认定机构确认。
无效的劳动合同自订立时就没有法律效力，但是，并不是任何人都有权宣布劳动合同无效，尤其是订立劳动合同的双方当事人，对合同是否有效均无权认定，根据此条规定，只能由人民法院或者劳动仲裁委员会来认定。无效劳动合同的确认机关特定劳动争议仲裁委员会或者人民法院，因为劳动合同双方当事人对劳动合同的法律效力发生争议时，应依照法律程序，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院起诉确定。
法律依据：《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条
发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
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