法律分析：
通行费电子发票，如果有税额，可以进行勾选确认并抵扣，申报时填入“认证相符的增值税专用发票”栏次；如果是不征税或免税发票则不能抵扣，若勾选时能显示出来，能需要勾选并确认 。
法律依据：
《中华人民共和国发票管理办法》 第二十三条 开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目,全部联次一次性如实开具,并加盖发票专用章。
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