当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。
时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
一、补充协议怎么写才有效
补充协议一般这样写：
一、主合同编号以及主合同中甲乙双方的基本信息
二、注明签订补充协议的原因
三、变更主合同条款的内容要写清
四、写明补充协议的效力
五、写明补充协议的生效时间
六、最后要有甲方和乙方签字盖章，签章是甲乙双方对协定补充事项的意思表示，表示愿意按照补充约定的内容履行相应的义务。
二、购房合同可以加备注吗，可以假设需要的条款
可以要求增加补充条款。合同遵循意思自治原则，在不违反法律强制性规定的前提下，合同的内容双方可以协商确定。当补充合同的约定与主合同的约定发生矛盾时，应该以时间在后的约定条款为准执行。所以，补充合同的效力优于主合同的效力。时间在后的约定，实际上是对主合同的原约定的重新修订，该新约定是补充合同的精要和实质。如果仍以主合同的原条款为准执行，那就失去了补充合同存在的意义。
三、合同顺延条款该怎么写
合同顺延条款的写法：
1、主合同双方需要签订；
2、需要明确延期的具体时间，并在协议中注明；
3、协议需要明确主合同的内容，或者以主合同为附件；
4、双方签字确认，当事人具有相应的民事权利和民事行为能力，依法享有自愿订立合同的权利。
合同延期是相对于主合同而言，变更主合同约定的期限的协议。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第五百一十条，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定;
或者约定不明确的，可以协议补充;不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
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