法律分析：不可以。根据法律规定，公司保安无权搜查员工摩托车。但相关法律规定，公司保安可以根据工作需要，登记出入公司的物品和车辆。即进行必要的检查是完全可以的。在单位管理范围内的人员，应当遵守单位的内部治安保卫制度。内部保安人员根据法律授权，对出入公司的物品与车辆可以进行检查并登记。
法律依据：《企业事业单位内部治安保卫条例》第十一条 单位内部治安保卫机构、治安保卫人员应当履行下列职责：（一）开展治安防范宣传教育，并落实本单位的内部治安保卫制度和治安防范措施；（二）根据需要，检查进入本单位人员的证件，登记出入的物品和车辆；（三）在单位范围内进行治安防范巡逻和检查，建立巡逻、检查和治安隐患整改记录；（四）维护单位内部的治安秩序，制止发生在本单位的违法行为，对难以制止的违法行为以及发生的治安案件、涉嫌刑事犯罪案件应当立即报警，并采取措施保护现场，配合公安机关的侦查、处置工作；（五）督促落实单位内部治安防范设施的建设和维护。
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