法律分析：证据合并过程中，如果遇到不公正的行为，被告方可以通过以下途径维护自身利益：一是向法院提出书面申请，要求法院组织证据的合法取得和认定；二是要求法院对证据的来源和真实性进行调查；三是要求法院公正审查和使用证据。同时，如果被告方认为法院未履行法定职责，可以向上级法院提起上诉或者申请再审。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第八十条、第一百一十二条、第一百一十四条；《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第三十四条、第四十一条；《中华人民共和国律师法》第十九条。
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