个人办理医疗机构许可证的方式是向县卫生局提交《医疗机构执业许可证》申请报告，并提供医疗机构用房产权证明或者使用证明等相关的资料。若是审核通过的，则发放许可证。
《医疗机构管理条例》第十八条县级以上地方人民政府卫生行政部门自受理执业登记申请之日起45日内，根据本条例和医疗机构基本标准进行审核。审核合格的，予以登记，发给《医疗机构执业许可证》；审核不合格的，将审核结果以书面形式通知申请人。《医疗机构管理条例》第三条医疗机构以救死扶伤，防病治病，为公民的健康服务为宗旨。