部门职责和权限对公司的组织结构有着重要的影响。组织结构是企业内部权责和职能关系的分配关系，是企业内部协作和协调的基础，而部门职责和权限则是组织结构的基础。
一方面，部门职责和权限的设置会影响公司的组织结构。不同的部门职责和权限需要不同的人员配备、职位设置和工作流程设计，从而形成不同的组织结构。例如，财务部门需要会计师和出纳等专业人才，而生产部门需要工程师和技术人员等专业人才。不同的部门需要不同的人才配备和职位设置，才能保证各部门的正常运转。
另一方面，公司的组织结构也会影响部门职责和权限的设置。组织结构的不同层次和形式会影响部门职责和权限的划分。例如，分权式组织结构下，各部门的职责和权限更为独立和自主；而集权式组织结构下，职责和权限更为集中和统一。因此，公司在制定部门职责和权限时，需要考虑到组织结构的不同层次和形式，从而使部门职责和权限与组织结构相适应。
总之，部门职责和权限与公司的组织结构密切相关，二者相互影响、相互制约。企业需要在制定部门职责和权限时，充分考虑到公司的组织结构，使之相互协调和适应，从而实现高效的企业运转。
参考来源：《组织行为学》（美）斯蒂芬·罗宾斯著，中国人民大学出版社，2014年。