公司档案管理制度是企业内部管理的重要组成部分，对于维护公司秩序、保护公司利益、确保信息安全具有重要意义。通常公司档案管理制度会规定文件的归档、保存、借阅、销毁等方面的具体规定，同时也会包括违规行为的惩罚措施。
关于公司档案管理制度的违规惩罚措施，一般会有以下几个方面的规定：
违规行为明确：首先，公司会明确规定哪些行为被认定为违规，例如私自篡改文件、擅自销毁文件、泄露机密信息等。
处罚力度：针对不同的违规行为，公司会规定相应的处罚力度，例如轻微违规可能会受到口头警告或书面警告，严重违规可能会受到停职、降职、解雇等处罚。
处罚程序：公司一般也会规定处罚的程序，例如是否需要经过内部调查、听取当事人陈述等程序。
申诉机制：为了保障员工权益，公司通常也会设置申诉机制，员工可以对公司的处罚做出申诉，公司会对申诉进行审查。
为了确保公司档案管理制度的有效执行，建议公司在制定违规惩罚措施时应该明确具体的违规行为、处罚力度、处罚程序，并要保障员工的申诉权利。同时，公司也应该定期对员工进行档案管理制度的培训，提高员工对于档案管理制度的认知和遵守程度。
举例来说，某公司的档案管理制度规定，如果发现员工私自篡改档案信息，将会受到严重警告甚至辞退的处罚。而在实际操作中，公司会先展开内部调查，听取当事人陈述，最终根据调查结果来确定处罚措施，确保公平公正。