1、温度。马铃薯籽种的贮藏，一般要求较低的温度，10～11月，马铃薯正处在后熟期，呼吸旺盛，这时应以降温散热、通风换气为主，最适温度应在4℃；贮藏中期的12月至第二年2月，正是气温处于严寒低温季节，马铃薯块易受冻害，这一阶段应是防冻保暖，温度应控制在13℃；贮藏末期3～4月份，气温转暖，窖温升高，籽种开始萌芽，这时应注意通风，温度应控制在4℃。
2、湿度。在马铃薯块茎的贮藏期间，保持窖内适宜的湿度，可以减少自然损耗和有利于块茎保持新鲜度。因此，当贮藏温度在13℃时，湿度最好控制在85%～90%之间，湿度变化的安全范围为80%～93%，在这样的湿度范围内，块茎失水不多，不会造成萎蔫，同时也不会因湿度过大而造成块茎的腐烂。
3、空气。马铃薯块茎的贮藏窖内，必须保证有流通的清洁空气，以减少窖内的二氧化碳。籽种长期贮藏在二氧化碳较多的窖内，就会增加田间的缺株率和长期植株发育不良，结果导致产量下降。通风又可以调节贮藏窖内的温度和湿度，把外面清洁而新鲜的空气通入窖内，而把同体积的二氧化碳等排出窖外。